张绍铃教授课题组领衔完成国际梨基因组计划
发布时间:2012-07-03 浏览次数:
 

近日,由南京农业大学梨工程技术研究中心牵头的国际梨基因组合作组织,已全面完成梨的精细基因组图谱绘制工作,这也是国际上第一个梨全基因组图谱。

该计划于2010年4月启动,以张绍铃教授为首带领的梨工程技术研究中心与深圳华大基因科技有限公司、浙江省农业科学院、美国伊利诺伊大学、美国乔治亚大学、美国夏威夷大学以及日本东北大学等7家国内外科研单位、60多位从事基因组研究的专家和成员通力合作,经过2年时间的测序、组装和注释等工作,取得了全面进展和突破。

通过“国际梨基因组计划”的实施,该研究中心以目前中国、也是世界栽培面积最大的品种——‘砀山酥梨’为样品开展全基因组测序,组装长度512.0M,约占梨基因组全长的97.1%,通过高密度遗传连锁图谱实现了与17条染色体的对应关系,注释梨的全基因集4万多个基因。并且首次应用新一代Illumina测序平台结合BAC-by-BAC策略,在没有物理图谱辅助的情况下,高质量的完成了高杂合、高重复序列的二倍体果树基因组组装。目前组装数据已由南京农业大学梨工程技术研究中心上传至“梨基因组计划”网站:peargenome.njau.edu.cn,并对外公开。

梨全基因组测序为揭示梨的自交不亲和性、树体生长发育规律、果实发育及品质形成、抗病虫、抗逆境等生物学特性的分子机制,以及重要功能基因的挖掘开辟了新的途径,为开展高产、优质、低投入梨新品种培育提供了一个全新的科技支撑平台,为梨产业的健康、可持续发展奠定了坚实的基础。同时,梨全基因组序列图谱的完成也为开展蔷薇科果树的比较基因组学以及进化研究提供了丰富的数据资源。

我国是梨的起源地,也是世界第一产梨大国,年产量占世界总量的60%以上。梨在我国的种植和分布范围非常广,除海南省、港澳地区外其余各省(市、区)均有种植,是仅次于苹果和柑橘的第三大水果。多年来,梨的分子生物学以及基因组学研究相对滞后,限制了基于功能基因挖掘和利用的定向育种以及分子遗传研究发展,已成为梨产业提升和科技进步的主要瓶颈之一。 据悉,梨的全基因组图谱完成将解决这一问题,带来梨科学研究与产业发展的新开端。