Hiseq2500高通量测序仪
发布时间:2014-11-25 浏览次数:
 
名 称: 高通量测序仪 型 号: HiSeq 2500
类 型: 基因组学设备 生产厂家: Illumina
价 格: 580万 来 源: 美国
购买时间: 2011-10-27
负责人: 游思亮、张芳 联系电话: 84395201
email: 收费标准:
所属部门: 国家重点实验室
技术指标: 1高数据通量:每次仪器运行单端读取至少可生成300G碱基数据,双端读取至少可生成600G碱基数据;在快速运行模式下27h内产生120G数据
2 实验时间:单端读取4天,双端读取8天(根据测序长度略有变化);快速模式27h
3运行成本:从样品制备到数据读取,每测量100万个碱基对所需成本不高于0.05美元
4数据读长:单端读取序列,读长大于100个碱基;
5双端读取序列:高通量模式读长2x100个碱基;快速模式读长2x150个碱基
6样品用量:DNA样本需要0.1-1微克gDNA或cDNA
7读取精度:原始数据准确性≥98.5%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%
8可精确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥98.5%
9不同样品并行性:每次仪器运行可平行分析8个非混合的独立样品
10 可开展ChiP-seq、小RNA发现的定量、未知物种测序、转录组研究、甲基化研究试剂盒,宏基因组研究、重测序、目标区域重测序。
使用范围: Hi-seq2500主要用途:
1.未知物种基因组的从头测序
2.已经测序物种的基因组重新测序
3.基因组尺度转录组学分析(Transcriptomics)
4.基因表达谱及基因调控研究
5.全基因组小分子RNA(miRNA)分析
6.染色质免疫互沉淀研究(ChIP)
7.多重单核苷酸多型性(SNP)分析
8.甲基化研究
9. 其他表观遗传学研究如磷酸化修饰
10.蛋白-DNA相互作用研究
11. 染色体重排研究(缺失,插入等等)